File.黒ずくめの組織とFBI 18
2016.9.23 発売 ｜ ONXD-4021
収録話
507話 カラオケボックスの死角（前編）
508話 カラオケボックスの死角（後編）
509話 赤白黄色と探偵団
510話 コナン vs W暗号ミステリー
511話 推理対決！新一 vs 沖矢昴
￥3,800+税 
File.黒ずくめの組織とFBI 17
2016.8.26 発売 ｜ ONXD-4020
収録話
501話 赤と黒のクラッシュ（嫌疑）
502話 赤と黒のクラッシュ（潔白）
503話 赤と黒のクラッシュ（決死）
504話 赤と黒のクラッシュ（殉職）
￥3,800+税
File.黒ずくめの組織とFBI 16
2016.7.22 発売 ｜ ONXD-4019
収録話
497話 赤と黒のクラッシュ（覚醒）
498話 赤と黒のクラッシュ（攪乱）
499話 赤と黒のクラッシュ（偽装）
500話 赤と黒のクラッシュ（遺言）
￥3,800+税
File.黒ずくめの組織とFBI 15
2016.6.24 発売 ｜ ONXD-4018
収録話
493話 赤と黒のクラッシュ（絶叫）
494話 赤と黒のクラッシュ（冥土）
495話 赤と黒のクラッシュ（昏睡）
496話 赤と黒のクラッシュ（侵入）
￥3,800+税
File.黒ずくめの組織とFBI 14
2016.5.27 発売 ｜ ONXD-4017
収録話
484話 黒い写真の行方（前編）
485話 黒い写真の行方（後編）
491話 赤と黒のクラッシュ（発端）
492話 赤と黒のクラッシュ（血縁）
￥3,800+税
File.黒ずくめの組織とFBI 13
2016.4.22 発売 ｜ ONXD-4016
収録話
462話 黒の組織の影 幼い目撃者
463話 黒の組織の影 奇妙な照明
464話 黒の組織の影 謎の高額報酬
465話 黒の組織の影 真珠の流れ星
封入特典：ジャケ絵柄ポストカード
￥3,800+税
File.黒ずくめの組織とFBI 12
2016.3.25 発売 ｜ ONXD-4015
収録話
427話 超秘密の通学路（前編）
428話 超秘密の通学路（後編）
429話 もう戻れない二人（前編）
430話 もう戻れない二人（後編）
封入特典：ジャケ絵柄ポストカード
￥3,800+税
File.黒ずくめの組織とFBI 10,11 限定BOX
2015.12.25 発売 ｜ ONXD-4013～4014
収録話
■Treasured Selection File.黒ずくめの組織とFBI 10
346話 お尻のマークを探せ（前編）
347話 お尻のマークを探せ（後編）
361話 帝丹高校学校怪談（前編）
362話 帝丹高校学校怪談（後編）
■Treasured Selection File.黒ずくめの組織とFBI 11
425話 ブラックインパクト！組織の手が届く瞬間(2.5H)
封入特典：ジャケ絵柄ポストカード
￥7,600+税
File.黒ずくめの組織とFBI 11
2015.12.25 発売 ｜ ONXD-4011
収録話
425話 ブラックインパクト！組織の手が届く瞬間（2.5H）
封入特典：ジャケ絵柄ポストカード
￥3,800+税
File.黒ずくめの組織とFBI 10
2015.12.25 発売 ｜ ONXD-4010
収録話
346話 お尻のマークを探せ（前編）
347話 お尻のマークを探せ（後編）
361話 帝丹高校学校怪談（前編）
362話 帝丹高校学校怪談（後編）
封入特典：ジャケ絵柄ポストカード
￥3,800+税
File.黒ずくめの組織とFBI 9
2015.9.25 発売 ｜ ONXD-4009
収録話
345話 黒の組織と真っ向勝負 満月の夜の二元ミステリー(120MIN)
封入特典：ジャケ絵柄ポストカード
￥3,800+税
File.黒ずくめの組織とFBI 8
2015.7.24 発売 ｜ ONXD-4008
収録話
340話 トイレに隠した秘密（前編）
341話 トイレに隠した秘密（後編）
343話 コンビニの落とし穴（前編）
344話 コンビニの落とし穴（後編）
封入特典：ジャケ絵柄ポストカード
￥3,800+税
File.黒ずくめの組織とFBI 7
2015.6.26 発売 ｜ ONXD-4007
収録話
309話 黒の組織との接触（交渉編）
310話 黒の組織との接触（追跡編）
311話 黒の組織との接触（決死編）
338話 4台のポルシェ（前編）
339話 4台のポルシェ（後編）
封入特典：ジャケ絵柄ポストカード
￥3,800+税
File.黒ずくめの組織とFBI 6
2015.4.24 発売 ｜ ONXD-4006
収録話
286話 工藤新一ＮＹの事件（事件編）
287話 工藤新一ＮＹの事件（推理編）
288話 工藤新一ＮＹの事件（解決編）
307話 残された声なき証言（前編）
308話 残された声なき証言（後編）
封入特典：ジャケ絵柄ポストカード
￥3,800+税
File.黒ずくめの組織とFBI 5
2015.2.27 発売 ｜ ONXD-4005
収録話
271話 隠して急いで省略（前編）
272話 隠して急いで省略（後編）
277話 英語教師VS西の名探偵（前編）
278話 英語教師VS西の名探偵（後編）
封入特典：ジャケ絵柄ポストカード
￥3,800+税
File.黒ずくめの組織とFBI 4
2015.1.23 発売 ｜ ONXD-4004
収録話
230話 謎めいた乗客（前編）
231話 謎めいた乗客（後編）
258話 シカゴから来た男（前編）
259話 シカゴから来た男（後編）
封入特典：ジャケ絵柄ポストカード
￥3,800+税
File.黒ずくめの組織とFBI 3
2015.1.23 発売 ｜ ONXD-4003
収録話
176話 黒の組織との再会編（灰原編）
177話 黒の組織との再会編（コナン編）
178話 黒の組織との再会（解決編）
226話 バトルゲームの罠（前編）
227話 バトルゲームの罠（後編）
封入特典：ジャケ絵柄ポストカード
￥3,800+税
File.黒ずくめの組織とFBI 1
2014.12.26 発売 ｜ ONXD-4001
収録話
1話 ジェットコースター殺人事件
2話 社長令嬢誘拐事件
54話 ゲーム会社殺人事件
128話 黒の組織10億円強奪事件
￥3,800+税